Le ressort territorial de la chambre s’étend au territoire de la région Bourgogne-Franche-Comté qui compte 2,8 millions d'habitants au 1er janvier 2021 pour une superficie de 47 784 km2.
La chambre régionale des comptes a compétence sur l’ensemble des collectivités et établissements publics locaux de la région.
À ces entités s’ajoutent les organismes dont le contrôle est délégué par la Cour des comptes et les organismes de droit privé soumis au contrôle facultatif de la chambre, en application de l’article L. 211-4 du code des juridictions financières : les sociétés d’économie mixte, les sociétés publiques locales, les associations et les organismes privés bénéficiant notamment de la part d’une collectivité territoriale d’un concours financier annuel supérieur à 1 500 euros.
Etablissements publics de coopération intercommunale et syndicats mixtes
Offices publics de l’habitat et groupements d’intérêt public
Établissements publics locaux d’enseignement et assimilés
Établissements publics de coopération culturelle
Autres
Organismes dont le contrôle est délégué par la Cour :
Etablissements publics de santé
Organismes consulaires
Autres