La chambre régionale des comptes de Franche-Comté est dirigée par un conseiller référendaire à la Cour des comptes, le président.
Le ministère public est assuré par un procureur financier.
La chambre régionale des comptes est composée en outre d'une présidente de section assesseur, de quatre magistrats instructeurs et de neuf assistants de vérification.
Le secrétaire général assure, sous l’autorité du président de la chambre régionale des comptes, le fonctionnement des services administratifs.
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La présidente de la chambre régionale des comptes de Franche-Comté
- Mme Marie-Christine Dokhélar, conseiller référendaire à la Cour des comptes
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Le procureur financier
- M. Thierry Farenc, premier conseiller, procureur financier par intérim
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Les magistrats et personnels de contrôle
Conseillers
- Mme Geneviève Guyénot, présidente de section
- Mme Sophie Tissot-Grossrieder, premier conseiller
- M. Nicolas Onimus, premier conseiller
- M. Nicolas Ferru, premier conseiller
- M. Antoine Desfretier, premier conseiller
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Assistants de vérification
Les assistants travaillent avec les magistrats à l'instruction des dossiers. Ils recueillent les données, les contrôlent et les analysent.
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Le secrétaire général et les services administratifs
Le secrétaire général est chargé de la gestion administrative et financière de la chambre. Il veille au bon fonctionnement des services administratifs dont notamment :
- le greffe : Les services du greffe enregistrent les actes relatifs aux contrôles à tous les stades de la procédure. Ses agents préparent et assistent aux séances hebdomadaires de la chambre, notent les décisions prises et assurent la tenue des registres et des dossiers. Le greffe conserve et actualise les dossiers de tous les organismes contrôlés par la chambre. Il établit également la liste des documents communicables au public.
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les archives : l'archiviste réceptionne et classe plus de 63 tonnes de liasses par an représentant les comptes de tous les organismes contrôlés par la chambre. Ces documents, sur lesquels travaillent les magistrats et leurs assistants, sont ensuite, selon leur nature, conservés au service des archives du département ou détruits.
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le centre de documentation : Les magistrats et assistants peuvent y consulter plus de 1 000 ouvrages et journaux spécialisés constamment actualisés.
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