Avec la Cour des comptes, les chambres régionales et territoriales des comptes (CRTC) forment les juridictions financières, institutions de contrôle du bon usage de l’argent public.
En pratique, les liens entre la Cour et les chambres régionales sont étroits, même si ces dernières sont des juridictions autonomes. Une programmation et des travaux communs nourrissent ainsi les rapports annuels de la Cour (rapport public annuel, rapport sur les finances publiques locales, rapports thématiques…). De même, la gestion matérielle et l’encadrement relèvent pour une grande partie de la Cour des comptes.
En particulier, la Cour dispose d’une mission d’inspection permanente des CRTC, présidée depuis 2018 par M. Pascal Duchadeuil, président de chambre de la Cour.