713 organismes publics relèvent de la compétence de la chambre au titre de la production des comptes de l'exercice 2018.
A ces entités publiques s'ajoutent les organismes consulaires et les organismes de droit privé soumis au contrôle facultatif de la chambre régionale des comptes de Bourgogne, Franche-Comté, en application de l'article L. 211-4 du code des juridictions financières :
- les sociétés d'économie mixte
- les sociétés publiques locales
- les associations et les organismes privés bénéficiant d'un concours financier annuel supérieur à 1 500 euros de la part d'une collectivité territoriale
Il en est de même, en application de l'article L. 211-7 du code des juridictions financières, d'une grande partie des personnes morales de droit privé à caractère sanitaire, social ou médico-social.