La chambre régionale des comptes de Midi-Pyrénées est en activité depuis 1983. Jean Mottes, conseiller référendaire à la Cour des comptes, en assure la présidence depuis août 2010.
Auparavant, la chambre a eu pour présidents :
- Pierre BAICHERE, conseiller maître à la Cour des comptes, de 1983 à1988 ;
- Philippe LIMOUZIN LAMOTHE, conseiller maître à la Cour des comptes, de 1989 à octobre 1999 ;
- Jean-Philippe VACHIA, conseiller maître à la Cour des comptes, de 1999 à juin 2005.
- Jean-Louis BEAUD DE BRIVE, conseiller maître de la Cour des comptes, de juin 2005 à juin 2010